近年休閒風氣日盛，許多民眾選擇以溫泉、SPA調劑養生，為降低感染退伍軍人症的可能性，疾病管制局提醒親水設施業者，應定期清洗和消毒親水設施。

疾管局表示，退伍軍人症主要是由「退伍軍人菌」引起，經由吸入或嗆入受到含有該菌的氣霧或水而致病，並不會造成人與人之間相互傳染。退伍軍人菌普遍存在自然界及人造用水設施中，特別喜歡在溫暖且停滯或流速緩慢的水中生長。

疾管局指出多數人對退伍軍人菌都有抵抗力，暴露在有退伍軍人菌的環境中，約只有5％的人會得病，特別是免疫功能較差的人，例如老人、吸煙、慢性肺部疾病或惡性腫瘤患者，及接受類固醇治療或器官移植者等高危險群。一般而言，退伍軍人菌對於身體機能正常的健康人威脅極小，且及早發現感染並給予適當的抗生素治療即可治癒，因此民眾不必過度恐慌，影響親水休閒活動的意願。

根據國外的研究顯示，水中退伍軍人菌的菌量多寡，與疫情發生的機率高低並無明顯關聯，因此應以「清除水中的退伍軍人菌，破壞其繁殖所需的條件」作為主要的防治觀念，定期針對供水系統進行清潔與消毒。為確保國人休閒用水安全，建議相關業者應加強營業場所親水設施之衛生管理，包括更新老舊的供水管線、保持良好的通風環境、保持溫泉或池水循環流暢、定期執行公共浴池清潔與消毒工作，及勤於清除池壁上的生物膜等，也應注意供水系統相關設備之清潔與消毒是否完善。同時，建議免疫力較差的民眾盡量避免使用SPA等噴霧設施，以降低感染退伍軍人病之風險。
此外，為加強醫療機構等退伍軍人菌感染高危險群聚集場所之管理，衛生署已自99年起將退伍軍人菌防治納入醫院感染控制查核項目，並於99年9月份公布「醫院退伍軍人菌環境檢測作業及其相關因應措施指引」，提供醫院有關供水系統中退伍軍人菌採檢機制、檢驗方法與標準、異常管理及醫療照護相關退伍軍人病感控措施等建議，以確保就醫民眾的健康。