依據指揮中心國際疫情監視及外館所提供資料顯示，日本新流感疫情本土病例已達21名，雖然疫情現況僅侷限在關西地區高中學校，惟依日本官方對疫情之研判，似已流行一段時間，且有擴大之可能。指揮中心表示，對照國內新流感疫情等級，日本仍屬第三級，將持續密切注意其疫情發展趨勢，並適時調整。
指揮中心呼籲，國人如欲前往日本關西地區，應避免前往兵庫高校、神戶高校及大倉高校等病例發生地區，並注意個人衛生、勤洗手；旅途期間如出現發燒、咳嗽等症狀，請儘速通知領隊，以協助就醫及通報。返國後，建議採行自主健康管理7日，如出現發燒、咳嗽等症狀，請撥打防疫諮詢及通報專線1922，由衛生人員協助就醫。另外，指揮中心已請各帶團前往日本旅遊之領隊密切注意疫情資訊，如旅遊途中或入境時發現有類流感症狀之旅客，請落實通報。
指揮中心已於今（5/17）日函請民航局轉知各航空公司，請於旅客登機前勸導有發燒、咳嗽等類流感症狀之旅客延緩搭機，或令其取得適航證明後始可搭機。若於航行途中，旅客出現上述症狀，應立即提供口罩，並安排遠離其他旅客之座位；飛機入境前，請事先通知航管單位，以利執行異常通報登機檢疫。指揮中心表示，自5/19上午8時起，同步取消原重點航班登機檢疫。